O Núcleo de Controle de Zoonoses realiza ações de vigilância, prevenção e controle de zoonoses, incluindo a busca ativa de escorpiões e aranhas, coleta de morcegos para análise laboratorial, monitoramento e combate à leishmaniose e à esporotricose, coleta de carrapatos para investigação de febre maculosa além de promover a vacinação antirrábica para cães e gatos. O setor atende à população em geral, atuando na proteção da saúde pública por meio da redução de riscos de doenças transmitidas por animais. Frase: Prevenir e controlar zoonoses por meio de vigilância ativa e ações estratégicas, protegendo a saúde da população.